La serie moderna y actual, con Russell T Davies como productor, comenzó a emitirse el 26 de marzo de 2005 con Christopher Eccleston como el Noveno Doctor y Billie Piper como su acompañante Rose Tyler. David Tennant como el Décimo Doctor debutó en la serie en la escena de regeneración del último capítulo de la primera temporada el 18 de junio de 2005, y más extensamente con un especial navideño el 25 de diciembre de 2005, mientras que la segunda temporada se iniciaba el 15 de abril de 2006. En la tercera temporada, que comenzó el 31 de marzo de 2007 en BBC One, a David Tennant se le uniría Freema Agyeman como su compañera Martha Jones quien a su vez sería sustituida en 2008 por Catherine Tate interpretando a Donna Noble, personaje que ya había aparecido en el especial de Navidad de 2006.