En 1604 el gobernador Pedro de Heredia construyó dos
torreones en el entorno de la
Puerta de
Santa Ana y de la Puerta del
Campo. En 1613 a
Melilla le fue concedida el título de ciudad. Para proteger las
huertas del
río de Oro, se construyeron los fuertes de Santiago en 1571, de
San Francisco y de San Marcos en 1575 y de San Lorenzo en 1583. En 1632 se construyó el Fuerte de San Pedro de la Albarrada y en 1637 se construyó el de
Santo Tomás de la Cantera. El 18 de julio de 1646 el gobernador Carlos Ramírez de Arellano murió en un combate contra los musulmanes a las afueras de la ciudad.