Llama mucho la atención debido a la edad que tenía al morir, la forma y tan desconocido gobierno del niño faraón. Se cree que es hijo de Akenatón, el Faraón Hereje (teoría respaldada por Zahi Hawass), aunque algunos sugieren que es hijo de Ay. Esta última teoría solo fue durante unos años y dejó de ser creída. Las evidencias (sin contar su ADN) son escasas (solo un bloque de piedra en El-Amarna), y el ADN de Tutankamón no puede ser comparado con el de Akenatón porque no se encontró su momia.