En su origen
Moguer fue una villa
romana con su
torre, reconvertida más tarde en alquería por los musulmanes. Esta pequeña entidad rural fue conquistada por la Orden de Santiago hacia 1239 – 1240 junto con otros enclaves del Algarve histórico, siendo anexionada a Castilla. El término de Moguer fue delimitado en 1.264. Tras un paréntesis en que formó parte de la jurisdicción del Concejo de
Niebla fue entregada por Alfonso XI en señorío a su almirante Alonso Jofre Tenorio en 1.333.