La cripta está dividida en tres
capillas, situadas bajo cada uno de los
ábsides. En la central está la imagen
románica de la
Virgen de la Soterraña, patrona de la ciudad junto con
Santa Teresa (en contra de lo que la mayoría de la gente cree, que es la Virgen de Sonsoles, cuando ésta es la patrona del vecino
Valle Amblés y de la Sierrecilla).