Colegio de los Jesuitas fue fundado en 1545 para acoger en él a los miembros de la orden que vinieran a formarse a Alcalá y con el tiempo llegaría a contar con dos cátedras propias de Teología, convirtiéndose así en facultad. en 1549, se trasladaran a su ubicación definitiva en la
Calle Libreros. Apoyados económicamente por personalidades de la nobleza y corte, fueron Dª María y Catalina de Mendoza, de la
casa de los marqueses de Mondejar y cuyo
escudo podemos ver en la
fachada de la
iglesia, quienes costearon la construcción del colegio (1620-1680) e iglesia (1567-1624).