Al construirse la actual
iglesia (1602) los sepulcros existentes en la iglesia de Santiago fueron reubicados en un subterráneo de la misma, al cual se bajaba por una
escalera de ochenta escalones que había en una
capilla debajo del
coro. Se discute si en una celda de la cripta, que hay debajo del
altar mayor, estuvo preso Francisco Quevedo, hay opiniones para todos los gustos. Francisco Gómez de Quevedo Villegas y Santibáñez Cevallos, conocido como Francisco de Quevedo, fue un escritor español del Siglo de Oro. Se trata de uno de los autores más destacados de la
historia de la literatura española, conocido especialmente por su obra poética, aunque también escribió narrativa,
teatro, y diversos opúsculos filosóficos, políticos, morales, ascéticos, humanísticos e históricos. En el siglo XVII se construyó el
patio del
monasterio, con dos pisos de galerías, el superior cerrado a modo de
balcones, así como la escalera que da acceso a este segundo piso.