La
Capilla Mayor o
Altar Mayor Cerrada por tres
rejas, destaca sobre todo la de la nave central, obra de Juan Francés, realizada entre 1511 y 1517. En una mezcla de transición del
gótico al renacimiento se aprecia la perfecta armonía entre la tupida y esbelta fila de los barrotes góticos con el gusto renacentista en los candelabros, frisos y sobre todo en la finísima labor de repujado de la gran crestería que remata en el
Calvario, rodeado de ángeles, pájaros y
flores. Las dos rejas que cierran sus laterales son posteriores, obras de Rafael Amezúa de Elorrio (1740).