Pero además este viaje produjo otros libros maravillosos, como “Zoología en el viaje del H. M. S. Beagle alrededor del mundo” (1838-1843), “Diario de la historia natural y la geología de los países visitados durante el viaje del HMS Beagle alrededor del mundo” (1845 y 1860), “Observaciones geológicas en las islas volcánicas durante el viaje del H. M. S. Beagle” (1844), “Observaciones geológicas en Sudamérica” (1846), “La estructura y distribución de los arrecifes de coral” (1874), etc., más una abundante correspondencia durante y luego del viaje. La culminación, tanto del viaje cuanto de los estudios que realizó a la vuelta sobre los especimenes recogidos, darán finalmente sus frutos en su obra más importante y polémica, “Sobre el Origen de las Especies”, de 1859.