En los años siguientes, Darwin se dedica a la investigación sobre la evolución de las especies. Los resultados de los estudios efectuados sobre los extraordinarios especímenes recogidos en su viaje, han demostrado que muchos de ellos eran evoluciones de especies anteriores, y que esas mutaciones se debían a la necesidad de adaptarse a cambios en su hábitat. Comienza entonces a elaborar una teoría sobre la transmutación. Pero sus investigaciones, que ya sonLibro sobre especias conocidas en el ambiente científico de la época, le acarrean algunos problemas con colegas naturalistas: sus teorías no son aceptadas con facilidad. Esto le provoca algunos problemas de salud, que hacen que se retrase la publicación de la obra que prepara para dar a conocer sus postulados. Finalmente decide abandonar la idea de la publicación.