Brant continuó con su trabajo misionero. Trató sin éxito de arreglar la venta de parte de la reserva a los colonos para ayudar a su pueblo, a pesar de la titularidad insatisfecha; y un acuerdo entre iroqueses y estadounidenses. Al final de su vida continuó el trabajo que había comenzado siendo joven, de traducir el Credo y pasajes importantes del Antiguo y Nuevo Testamento al idioma Mohawk. Murió el 24 de agosto de 1807 en la reserva de Ontario, donde el pueblo de Brantford aún lleva su nombre.