Otros rastros: El consumo sobre frutos secos, mayoritariamente consumidos por el lateral y el resto por el extremo inferior, muy raramente por el extremo superior, es su mejor rastro. El corte es muy redondeado y perfecto, presentando marcas de fuera adentro, apreciables visualmente o mejor con ayuda de una lupa. Este corte en frutos como las almendras se diferencian claramente de los de ratón de campo en que el moruno no deja impresa la corona junto al corte propio del ratón de campo (Apodemus sylvaticus). El cadáver del ratón moruno, o su presencia en egagrópilas de aves son otros buenos rastros para asegurar su presencia en un territorio concreto.