El Paraninfo está ubicado en la galería baja norte del patio de las Escuelas Mayores, en la esquina Este. Se encuentra entre el Aula Fray Luis de León y el Aula Francisco de Vitoria. Posee obras artísticas de gran valor, como estandartes de terciopelo carmesí, grisallas, retratos (como el de Carlos IV) o tapices (ocho en total, los cuales datan del siglo XVII). El paraninfo acoge numerosos actos y ceremonias académicas tan destacadas como la ceremonia de inauguración del curso académico o los actos de investidura de Doctorado honoris causa. Cuenta con una superficie de 350 m²; debido a esto, llegó a acoger clases de Derecho canónico, que en siglos pasados era una de las especialidades más demandadas.