Está formada por el cierre de un dique fluvial del Arroyo del Rincón, 1 afluente del río Júcar, formando un espacio lagunar. El Arroyo del Rincón llega a la Laguna de Uña tras pasar, primeramente, por la piscifactoría de trucha común de Uña2 y después, por la Escuela Regional de Pesca Fluvial3 de la misma localidad.
En la actualidad, la Laguna de Uña forma parte del Parque Natural Serranía de Cuenca, creado mediante la Ley de la Comunidad Autónoma de Castilla-La Mancha 5/2007.